[ad_1]

محققان راهی ساده برای از بین بردن تقریباً تمام خطاهای توالی یابی تولید شده توسط یک توالی سنج قابل حمل DNA پرکاربرد یافته اند ، به طور بالقوه به دانشمندان شاغل در خارج از آزمایشگاه امکان می دهد تا میکروارگانیسم هایی مانند ویروس SARS-CoV-2 را به طور مثر بررسی و ردیابی کنند.

با استفاده از نشانگرهای مولکولی ویژه ، تیم قادر به کاهش میزان خطا از 5 به 15 درصد از دستگاه MinION Oxford Nanopore Technologies به کمتر از 0.005٪ بود – حتی در صورت ایجاد کشش های بسیار طولانی DNA.

رایان زیلز ، دستیار مهندسی عمران در دانشگاه بریتیش کلمبیا و یکی از نویسندگان این مطالعه که این هفته در روشهای طبیعی. “اما تاکنون محققان نتوانسته اند در بسیاری از تنظیمات به دستگاه اعتماد کنند زیرا نسبتاً زیاد خطای آن خارج از جعبه است.”

توالی های ژنومی می توانند چیزهای زیادی را در مورد یک ارگانیسم نشان دهند ، از جمله هویت ، منشا آن و نقاط قوت و آسیب پذیری آن. دانشمندان از این اطلاعات برای درک بهتر میکروب های ساکن در یک محیط خاص و همچنین توسعه ابزارهای تشخیصی و درمان استفاده می کنند. اما بدون توالی دقیق DNA قابل حمل ، می توان هنگام انجام تحقیقات میدانی یا در آزمایشگاه های کوچکتر ، جزئیات اصلی ژنتیکی را از دست داد.

بنابراین Ziels و همکارانش در دانشگاه آلبورگ یک سیستم بارکدگذاری منحصر به فرد ایجاد کرده اند که می تواند سیستم عامل های خواندن DNA پی در پی مانند MinION را بیش از 1000 برابر دقیق تر کند. پس از برچسب زدن به مولکولهای هدف با این بارکدها ، محققان طبق معمول با استفاده از روش استاندارد PCR و تعیین توالی DNA حاصل ، تکثیر یا ساختن چندین نسخه از مولکولهای دارای برچسب را آغاز کردند.

محققان می توانند با استفاده از بارکد به راحتی قطعات DNA مربوطه را در داده های توالی یابی شناسایی و گروه بندی کنند و در نهایت توالی تقریباً کاملی از قطعات ایجاد کنند که تا 10 برابر بیشتر از فن آوری های معمول است. بخشهای طولانی تر DNA می تواند حتی تغییرات ژنتیکی جزئی و جمع آوری ژنومهایی با وضوح بالا را تشخیص دهد.

Ziels که تیم آنها کد و پروتکل پردازش داده های توالی را از طریق مخازن منبع باز در دسترس قرار داده است ، گفت: “نکته قابل توجه در مورد این روش این است که برای هر ژن مورد علاقه ای که قابل تکثیر است قابل استفاده است.” “این بدان معنی است که می تواند در هر زمینه ای که ترکیبی از اطلاعات ژنومی با دقت بالا و طولانی مدت ارزشمند باشد ، مانند تحقیقات سرطان ، تحقیقات گیاهی ، ژنتیک انسانی و میکروبیوم بسیار مفید باشد.”

Ziels در حال حاضر با Metro Vancouver در حال توسعه نسخه گسترده ای از روش است که به شما امکان می دهد میکروارگانیسم ها در آب و فاضلاب را در زمان واقعی تشخیص دهد. Ziels می گوید ، با داشتن تصویری دقیق از میکروارگانیسم های موجود در سیستم های آبی آنها ، جوامع می توانند استراتژی های بهداشت عمومی و فن آوری های درمانی خود را بهبود بخشند – و میکروارگانیسم های مضر مانند SARS-CoV-2 را بهتر کنترل کنند.

تاریخچه تاریخ:

مواد تهیه شده توسط دانشگاه بریتیش کلمبیا. توجه: مطالب را می توان از نظر سبک و طول ویرایش کرد.

[ad_2]

منبع: unbox-news.ir