شبیه سازی ها نشان می دهد که چگونه سویه غالب SARS-CoV-2 به میزبان متصل می شود ، به آنتی بادی ها پاسخ می دهد – ScienceDaily

[ad_1]

شبیه سازی ابر رایانه ای در سطح اتمی در مقیاس بزرگ نشان می دهد که نوع G غالب ویروس عامل COVID-19 به دلیل توانایی بیشتر آن در اتصال آسان به گیرنده میزبان هدف در بدن ، نسبتاً به سایر انواع ، مسری است. نتایج این مطالعات توسط تیمی به سرپرستی آزمایشگاه ملی در لوس آلاموس مکانیسم عفونت از طریق فرم G و مقاومت آنتی بادی ها را در برابر آن روشن می کند ، که ممکن است به تولید واکسن در آینده کمک کند.

خبرنگار گننا گناناکاران ، خبرنگار مقاله ، گفت: “ما دریافتیم که فعل و انفعالات بین عناصر اصلی سازنده پروتئین Spike در شکل G متقارن تر می شود و این باعث می شود فرصت بیشتری برای اتصال به گیرنده های میزبان – در ما فراهم شود”. منتشر شده امروز در پیشرفت علمی. “اما در عین حال ، این بدان معنی است که آنتی بادی ها می توانند راحت تر آن را خنثی کنند. اساساً ، این گزینه سر خود را به گیرنده متصل می کند ، و به آنتی بادی ها اجازه می دهد تا به آن حمله کنند.”

محققان می دانستند که این نوع ویروس که به آن D614G نیز می گویند مسری تر است و می تواند توسط آنتی بادی خنثی شود ، اما آنها نمی دانستند که چگونه. با شبیه سازی بیش از یک میلیون اتم منفرد و نیاز به حدود 24 میلیون ساعت پردازنده برای زمان ابر رایانه ، کار جدید جزئیاتی را در سطح مولکولی رفتار اسپایک در مورد این نوع ارائه می دهد.

واکسن های موجود علیه SARS-CoV-2 ، ویروسی که باعث ایجاد COVID-19 می شود ، بر اساس شکل اصلی ویروس D614 است. این درک جدید از نوع G – گسترده ترین شبیه سازی ابر رایانه G شکل در سطح اتمی – می تواند به معنای ارائه ستون فقرات برای واکسن های آینده باشد.

تیم تحقیقاتی در اوایل سال 2020 با رشد بیماری همه گیر COVID-19 ناشی از ویروس SARS-CoV-2 ، نوع D614G را کشف کردند. این یافته ها در Cell منتشر شده است. دانشمندان جهش در پروتئین Spike را مشاهده کرده اند. (در همه انواع ، این پروتئین Spike است که تاج مشخصه آن به ویروس را می دهد.) این جهش D614G ، به دلیل اسید آمینه در موقعیت 614 در ژنوم SARS-CoV-2 ، که با اسید اسپارتیک جایگزین شده است ، شایع است در سراسر جهان برای چند هفته.

پروتئین های سنبله از طریق حوزه اتصال گیرنده اسپایک به یک گیرنده خاص موجود در بسیاری از سلول های ما متصل می شوند ، که در نهایت منجر به عفونت می شود. این اتصال به دامنه اتصال گیرنده نیاز دارد تا از یک ساختار بسته که نمی تواند به یک ساختار باز که می تواند متصل شود ، به صورت ساختاری حرکت کند.

شبیه سازی ها در این مطالعه جدید نشان می دهد که فعل و انفعالات بین عناصر سازنده Spike در شکل G جدید بیشتر از فشار اصلی D شکل متقارن است. این تقارن منجر به افزایش سن ویروس ها در شکل باز می شود ، بنابراین می تواند به راحتی شخص را آلوده کند.

تیمی از دانشجویان دکترا از لوس آلاموس – راشل A. منسبباخ (اکنون استادیار فیزیک در دانشگاه کنکوردیا) ، Srirupa Chakraborty و Kien Nguyen – با انجام چندین شبیه سازی در هر میکروثانیه از هر دو نوع در هر دو ساختار اتصال گیرنده ، این مطالعه را هدایت کردند. نحوه تعامل پروتئین Spike با گیرنده میزبان و آنتی بادی های خنثی کننده را روشن می کند ، که ممکن است به محافظت از میزبان در برابر عفونت کمک کند. اعضای تیم تحقیقاتی همچنین بت کوربر از آزمایشگاه ملی در لوس آلاموس و دیوید سی مونتفیوری از م Instituteسسه دوک واکسن های انسانی بودند.

این تیم از پل وبر ، رئیس محاسبات سازمانی در لس آلاموس ، برای دسترسی به ابر رایانه های آزمایشگاهی برای این مطالعه تشکر کرد.

این گزارش: “مدل S6S-CoV-2 Spike D614G از یک حالت ساختاری باز پشتیبانی می کند” پیشرفت علمی. Rachael A. Mansbach، Srirupa Chakraborty، Kien Nguyen، David C. Montefiori، Bette Korber، S. Gnanakaran.

بودجه: این پروژه توسط یک پروژه تحقیق و توسعه در آزمایشگاه لوس آلاموس 20200706ER ، بورس تحصیلی مدیر و برنامه دکترا در مرکز تحقیقات غیر خطی لوس آلاموس پشتیبانی می شود

[ad_2]

منبع: unbox-news.ir

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>