محققان در حال توسعه یک استراتژی سریع ژنومی برای ردیابی ویروس کرونا هستند – ScienceDaily


به لطف پیشرفته ترین تکنولوژی تعیین توالی ژن نانوپور ، محققان موسسه تحقیقات پزشکی گاروان و موسسه کربی در UNSW سیدنی سریعترین استراتژی تعیین توالی ژن ویروس کرونا را در استرالیا تاکنون ارائه داده اند. پیشرفت های فنی این توانایی را دارد که شواهد به موقع و اساسی راجع به ارتباط عفونت های SARS-CoV-2 ارائه دهد.

امروز ، محققان اعتبار سنجی تحلیلی و بهترین دستورالعمل ها برای توالی SARS-CoV-2 nanopore را در ارتباطات طبیعتکه امیدوارند بتوانند از فناوریهای سریع برای اقدامات بهداشتی در استرالیا و خارج از کشور استفاده کنند.

“هر بار که ویروس SARS-CoV-2 از فردی به فرد دیگر منتقل شود ، می تواند خطاهای کپی برداری ایجاد کند که چندین مورد از 30000 حرف ژنتیکی را تغییر می دهد. با شناسایی این تنوع ژنتیکی ، می توان نحوه ارتباط موارد مختلف ویروس کرونا را تعیین کرد. A / پروفسور Rowena Bull از موسسه کربی UNSW گفت: “من می دانم که پرونده به طور بالقوه از کجا انتخاب شده و به چه کسی منتقل شده است.”

A / پروفسور بول می گوید که آزمایشات ژنومی برای ردیابی انتقال ویروس در مواردی که منبع فقط از بررسی تماس های اپیدمیولوژیک شناخته شده مشخص نیست ، بسیار مهم است.

وی گفت: “با بازسازی تاریخچه تکاملی ویروس یا” شجره نامه “، می توان رفتاری را که به COVID-19 کمک می کند تا گسترش یابد و به اصطلاح” فوق گسترش دهنده ها “شناسایی کند ، درک کنیم.

یک نویسنده ارشد می گوید: “هنگامی که مورد جدیدی از رمز و راز ویروس کرونا شناسایی می شود ، هر دقیقه مهم است. در گاروان ، ما توانایی توالی یابی ژنی خود را مجدداً متمرکز کرده ایم تا فقط در طی چند ساعت تجزیه و تحلیل سریع ژن ویروس کرونا انجام شود.” دکتر ایرا دوسون ، رئیس گروه فناوری ژنومیک در مرکز ژنومیک بالینی ریون در گاروان.

وی گفت: “ما از همکاری با م Garسسات Garvan و Kirby برای ایجاد نرخ بی نظیر آزمایش ژنوم ویروس کرونا خوشحال شدیم. روشهای سریع این روش راهی پیش رو به عنوان گزینه بالقوه آینده برای ردیابی تماس ها از طریق مطالعات انتقال ژنومی در زمان واقعی است.” پروفسور بیل راولینسون AM از UNSW سیدنی و NSW Health Pathology Randwick.

پروفسور سباستین ون هال از آسیب شناسی بهداشت NSW در بیمارستان رویال پرنس آلفرد می گوید: “این پیشرفت فنی اثبات آنچه ممکن است باشد ، در صورتی که آسیب شناسی عمومی با م institسسات تحقیقاتی برای یک هدف مشترک همکاری می کند.”

پیشگام ژنومیک سریع

تشخیص سریع انتقال SARS-CoV-2 بسیار مهم است. NSW Health Pathology با همکاری م Garسسه گاروان و م Kirسسه کربی در حال توسعه توانایی های سریع تر برای تعیین توالی ژنوم SARS-CoV-2 است که به طور بالقوه توانایی مسیرهای تماس را برای اقدام سریع در قرنطینه و نظارت بر تماس های بالقوه بهبود می بخشد. محققان گاروان پروتکل هایی برای پیشرفته ترین فناوری Oxford Nanopore Technologies برای تعیین توالی SARS-CoV-2 را در کمتر از چهار ساعت تصفیه کرده اند. مرکز ژنومیک بالینی Kingvan گاروان اولین تاسیساتی در استرالیا برای ایجاد و پیاده سازی این فناوری Nanopore برای مشاهده ژنومی SARS-CoV-2 است.

فن آوری های نوظهور بسیار دقیق

روش استاندارد طلای فعلی توالی های ژنتیکی کوتاه را فقط با 100-150 حرف ژنتیکی در یک زمان می خواند ، در حالی که فناوری های نانوپور محدودیت بالایی در طول قطعات DNA ندارند که بتوان توالی یابی کرد و می توانند با سرعت بیشتری توالی کامل ژنوم ویروسی را تعیین کنند.

دکتر می گوید: “با این وجود ، مانند بسیاری از فناوری های نوظهور ، نگرانی هایی در مورد صحت تعیین توالی نانوپور وجود دارد. ما در مقاله خود به این نگرانی ها پرداختیم ، جایی که ما نتایج یک ارزیابی تحلیلی دقیق از پروتکل های تعیین توالی ژن کرونا ویروس را گزارش می دهیم.” دوسون

تجزیه و تحلیل محققان نشان داد که روش تعیین توالی نانوپور بسیار دقیق است (انواع مختلفی با حساسیت> 99٪ و دقت 99٪ در 157 نمونه از بیماران مبتلا به SARS-CoV-2 یافت شد) و بهترین رهنمودهای عملی را ارائه می دهد که محققان امیدوارند که معرفی فناوری توسط تیم های دیگر در سراسر جهان را تشویق کنند.

محققان می گویند که تعیین توالی نانوپور حتی توانایی بهبود نظارت بر SARS-CoV-2 را دارد که امکان توالی نقاط مراقبت و بهبود زمان اجرا را برای موارد مهم فراهم می کند.

دکتر دوسون گفت: “دستگاه های نانوپور ارزان تر ، سریع تر ، قابل حمل هستند و به زیرساخت آزمایشگاهی مورد نیاز ابزارهای استاندارد فعلی برای ژنومی پاتوژن نیاز ندارند.” “ما امیدواریم که اعتبار این پروتکل به سایر تیم های بهداشت عمومی در سراسر جهان برای استفاده از این فن آوری کمک کند.”

این مطالعه ، منتشر شده در ارتباطات طبیعت توسط طرح واکنش سریع UNSW COVID-19 ، صندوق تحقیقات پزشکی آینده (محقق گرانت APP1173594) ، انستیتوی سرطان NSW و بنیاد کینگ هورن پشتیبانی شد.


منبع: unbox-news.ir

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>